内蒙古自治区特色药用植物培育与保护工程技术研究中心（工程中心）主要由植物化学实验室、组织培养实验室、分子鉴定实验室、药理实验室等构成。共有实验用房10间，科研用房面积达900平方米，是从植物资源保护到分子鉴定的多方位全面发展的实验室。中心仪器设备较为完善，包括LC-MC、GC-MS、ICP-AES、HPLC、微波消解仪、实时无标记细胞功能分析仪、旋转蒸发仪、二氧化碳超临界萃取仪、制备液相等，总值5000多万元。
    工程中心重点研究方向为：①内蒙古自治区特色珍稀濒危和大宗药用植物资源保护研究；②内蒙古自治区特色珍稀濒危和大宗药用植物种质研究；③内蒙古自治区特色珍稀濒危和大宗药用植物资源迁地保护研究；④促进内蒙古地区制药企业与高校的产、学、研紧密联系。为了对特色道地药材进行保护，工程中心构建了内蒙古自治区第一个药用植物种质资源库、第一个特色珍稀濒危和大宗药用植物标本馆、第一个特色蒙药药用植物人工气候室和2个国家基本药物中药原料资源动态监测与信息服务站（监测站）。同时，为了缓解了本区特色蒙药材资源保护和开发利用之间的矛盾，工程中心与内蒙古和信园蒙草抗旱绿化股份有限公司、石家庄以岭药业股份有限公司合作开展长期技术合作，提出并开发麻黄规范化种植及产地加工技术，深度挖掘蒙药材的社会价值和经济价值，并制定1套药材生长地区适宜的规范化种植及产地加工技术技术规程（SOP）及相关标准；与中国药材公司、内蒙古诚信药业、赤峰荣兴堂药业等多家药业合作建立多种特色蒙药（黄芪、小秦艽、桔梗、赤芍、枸杞、黑果枸杞、肉苁蓉、山沉香等）种质种苗繁育示范基地、规范化种植示范基地共2600余亩，获得了良好的“产-学-研”结合效果。
    目前，工程中心共承担国家、自治区重大科技计划项目40余项（其中科技部支撑计划1项，国家自然基金3项，教育部重点项目1项，国家中医药管理局项目3项），已结题10项。工程中心一直重视队伍建设、人才引进和培养。现拥有团队固定成员42名，其中高级职称8人，硕士生导师10人，博士学位者8人。客座人员7人，其中1名中国工程院院士被聘为实验室学委会主任，高级职称6人，硕士生导师7人，博士学位者7人。
    工程中心的建立不但有利于缓解野生植物资源匮乏以及内蒙古特色药用植物道地药材资源供需之间日益增长的矛盾，而且有利于缓解生态环境日益脆弱与内蒙古特色药用植物需求量剧增之间的矛盾，加快具有民族特色的内蒙古特色药用植物开发研究步伐，推进内蒙古特色药用植物现代化进程。